全系积极参与了多项国家级的建设项目，其中包括承担了国家高技术自动化领域重点项目“计算机集成制造系统（CIMS）”实验工程建设和“集成化化管理与决策信息系统（I-MADIS）”开放实验室的建设任务，并受国家科委的委托主管CIMS主题办公室的工作。在校内外各单位大力协作共同努力下，经过五年半奋战，CIMS实验工程于1992年底建成并通过国家验收，成为具有国际先进水平的自动化科学技术工程研究中心，并于1995年荣获美国制造工程师学会颁发的国际大奖“大学领先奖”。 随着改革开放的进一步扩大，我系从1997年开始相继与多家国际公司建立了合作关系，先后成立了与美国Rockwell、日本NEC和OMRON、德国Festo和P＋F等公司建立了联合实验室。这些实验室的建立为我系教学和科研工作发挥了积极的作用。 1999年我系配合学校进行的体制改革，将原有的8个教研组调整为6个研究所，即控制理论及应用研究所、系统集成技术研究所、信息处理技术研究所、过程控制技术研究所、系统工程研究所和电子及检测技术研究所。
