2007年，自动化系成立导航与控制研究中心；2016年，成立导航与控制研究所。
研究所依托“导航、制导与控制”二级学科建设，针对天基、空基、地基等特种智能机器人系统，开展了系统总体设计、智能导航与控制、智能博弈与决策等关键理论与技术研究。研究方向包括智能机器人技术与系统、多智能体理论与技术、飞行控制与管理技术、航天器导航与控制技术等。
在科研方面，研究所牵头承担并完成了包括国家863智能机器人重大项目、国家 973 项目、创新特区重点项目、国家大型客机研制重大专项项目、科技部重点研发计划项目、自然基金重点项目和面上项目等，获得国家科技进步特等奖 1 项、省部级科技进步一等奖 4 项、科技进步二等奖 1 项。
在教学方面，研究所面向本科生、研究生开设了《导航、制导与控制》《飞行控制系统》《空间机器人》《太空机器人技术研讨》《智能机器人》《自动控制原理》等多门与机器人、智能无人系统、航天航空器控制相关的课程。
