师资队伍

师资队伍

张鹏

副研究员
信息处理研究所
清华大学北京市中医药交叉研究所
教育背景

    2010年9月-2014年6月, 同济大学自动化系, 获学士学位

    2014年9月-2020年8月, 清华大学自动化系, 获博士学位

工作履历

    2024年9月-至今,清华大学北京市中医药交叉研究所 副所长

    2025年12月-至今, 清华大学自动化系, 副研究员

    2023年2月-2025年12月, 清华大学自动化系, 助理研究员

    2020年9月-2023年3月, 清华大学自动化系, 博士后

学术兼职

    1. 中华中医药学会青年委员会 委员

    2. 世界中医药联合会网络药理学专业委员会 常务理事

    3. WJIM、Chinese Medicine等杂志编委/青年编委

研究领域

    1. 网络药理学

    2. 智能中医药

    3. 医学大数据智能分析算法

    4. 胃癌等消化道肿瘤中西医智能防治

研究概况

    研究方向为中医药人工智能、网络药理学与智能健康,长期从事基于中医药人工智能算法及其在胃癌中西医极早防治的应用研究,并担任清华大学“数字生物学与智能健康”因材施教计划导师。以项目/课题负责人身份主持纵向课题经费累计超1000万元。

    [1] 教育部,学科突破先导项目,中医药防治多系统共患疾病学科突破先导项目(课题),2025-09至2030-08,720万,在研,主持;

    [2] 国家中医药管理局,国家中医药多学科交叉创新团队项目,基于 AI 的胃炎癌转化中医药防治体系研究(课题),2025-06至2028-08,150万,在研,主持;

    [3] 国家自然科学基金委员会, 青年科学基金, 82305047, 胃癌极早期的多层次生物网络与中药干预机制研究, 2024-01至2026-12, 30万元,在研,主持;

    [4] 国家中医药管理局,中医药原理解读计划,网络药理学应用于中药新药研发专家共识意见编制项目,2023-12至2024-12,10万元,在研,主持;

    [5] 人力资源与社会保障部,博士后创新人才计划,BX2021162, 2021年度,60万元,结题,主持;

    [6] 科技部国家重点研发计划,青年科学家项目,2023YFC3504700, 类风湿关节炎的免疫代谢昼夜节律紊乱与中医诊疗规律研究,2023-11至2027-10,300万元,在研,研究任务(子课题)负责人。

    [7] 清华大学,青年教师科研原创项目,面向胃癌智能预警的中医药多模态关系推断模型研究, 2025-05至2026-05,20万元,在研,项目负责人

    [8] 国家自然科学基金委员会, 专项项目, T2341008, 胃癌“未病”的生物基础与数学表征, 2023-01至2025-12, 300万元,在研,骨干;

    [9] 国家自然科学基金委员会, 重点项目, 6183000133, 基于生物网络的病证结合研究方法, 2017-01至2021-12, 275万元, 结题, 参加;

    [10] 国家自然科学基金委员会, 重点项目, 91229201, 炎症向肿瘤转化的生物分子网络与平衡机制, 2013-01至2016-12, 300万元, 结题, 参加.

奖励及荣誉

    科技奖励:

    [1] 中华中医药学会科学技术奖一等奖(第2完成人, 2025

    [2] 北京市科学技术奖科技进步一等奖(第8完成人, 2024

    [3] 日内瓦国际发明展特别嘉许金奖(最高等级,第2完成人, 2024

    [4] 日内瓦国际发明展金奖(第2完成人, 2024

    [5] 中医药国际贡献奖一等奖(第4完成人, 2021

    [6] 中医药十大学术进展(2024

    [7] 中国生物信息学十大应用(2019

    个人荣誉:

    清华大学水木学者(自动化系年度唯一入选者)

    清华大学紫冬学者

    国家博士后创新人才计划

    国家中医药管理局中药网络药理学高水平重点学科后备学术带头人

    国家多学科交叉创新团队重点培养骨干人才

    北京市优秀毕业生、清华大学“一二九”辅导员奖等

学术成果

    在网络靶标理论指引下,建立了病证宏观-中观-微观跨层次网络关系推断的系列高精度AI算法,率先发现胃癌极早期这一表征胃炎癌转化临界状态的全新分期及其中西医特征与生物标志物,破解胃癌发生预警难题,被Nature论文评为“显著性(notably)”发现;构建胃癌极早期中西医智能防治体系,在我国胃癌高发区以及全国80余家落地应用,显著提升了胃炎癌转化中西医防治水平。在Nature Methods, Cancer Discovery, Nature Communications, Cell Reports、STTT等国际高水平杂志发表论文20余篇(10篇IF > 10),入选Lancet子刊封面论文、F1000杰出论文、ESI热点论文(全球top 0.1%)。参编教材2部。授权中国发明专利3项(均转化)、日本发明专利1项。

    代表性研究论文(*共同第一作者)

    1. Zhang P*, Gao C*, Hua K, Zhang ZY, Li S. Systematically decoding pathological morphologies and molecular profiles with unified multimodal embedding. Nature Methods 2026 (accepted).

    2. Zhang P, Zhang Q, Li S. Advancing Cancer Prevention through an AI-Based Integration of Traditional and Western Medicine. Cancer Discovery 2024;14(11):2033-2036. (IF = 30.60, 该杂志首篇中医药主题论文)

    3. Zhang P*, Gao C*, Zhang Z, Yuan Z, Zhang Q, Zhang P, Du S, Zhou W, Li Y, Li S. Systematic inference of super-resolution cell spatial profiles from histology images. Nature Communications. 2025;16(1):1838.

    4. Zhang P, Yang M, Zhang Y, Xiao S, Lai X, Tan A, Du S, Li S. Dissecting the Single-Cell Transcriptome Network Underlying Gastric Premalignant Lesions and Early Gastric Cancer. Cell Reports. 2019 May 7;27(6):1934-1947.e5. (F1000杰出论文,2019年中国生物信息学十大应用、单细胞测序领域最受关注科研进展,被引452次)

    5. Zhang P*, Zhang DF*, Zhou WA*, Wang L, Wang BY, Zhang TY, Li S. Network pharmacology: towards the artificial intelligence-based precision traditional Chinese medicine. Brief Bioinform. 2023 Nov 22;25(1): bbad518. (被引590次, ESI全球top 0.1%热点论文、高被引论文,杂志最高阅读量论文)

    6. Zhang P, Li S. Human cross-tissue cell atlases: unprecedented resources towards systematic understanding of physiology and diseases. Signal Transduct Target Ther. 2022 Oct 5;7(1):352. (IF = 38.10)

    7. Zhang P, Wang B, Li S. Network-based cancer precision prevention with artificial intelligence and multi-omics. Science Bulletin. 2023;68(12):1219-1222 (IF = 20.58).

    8. Guo JC*, Zhang P*, Zhou L*, You L*, Liu QF, Zhang ZG, Sun B, Liang ZY, Lu J, Yuan D, Tan AD, Sun J, Liao Q, Dai MH, Xiao GG, Li S, Zhang TP. Prognostic and predictive value of a five-molecule panel in resected pancreatic ductal adenocarcinoma: A multicentre study. EBioMedicine. 2020 Apr 28;55:102767. (IF = 11.20, cover)

    9. Hou S*, Zhang P*, Yang K*, Wang L, Ma C, Li Y, Li S. Decoding multilevel relationships with the human tissue-cell-molecule network. Brief Bioinform. 2022 Sep 20;23(5):bbac170. (IF = 13.99)

    10. Zhang F*, Zhou Z*, Zhang P*, Li S. Multi-Omics Meets Premalignancy: Paving the Way for Early Prevention of Cancer. Research (Wash D C). 2025;8:0930. (IF = 10.7)

    发明专利

    [1] 李梢, 张鹏. 一种胃癌极早期细胞标志和胃癌前病变早期细胞标志及其在诊断试剂盒中的应用. 中国,ZL202080001970.7. (已转化)

    [2] 李梢, 张鹏. 确定胃癌极早期发生风险及评估胃癌前病变进展风险的分子标志及其在诊断试剂盒中的应用. 中国,ZL 202111236948.3. (已转化)

    [3] 赵玉沛, 李梢, 郭俊超, 张鹏, 周立. 一种组合标志物在制备胰腺癌预后判断试剂盒中的应用及其测定系统和方法. 中国, ZL 201611038981.4. (已转化)

    [4] 李梢, 张鹏. 胃がんの超早期発生リスクを確定し胃がんの前が ん病変の進行リスクを評価する分子マーカー及び その診断キットにおける応用. 日本, 2024-524380.